miércoles, 8 de octubre de 2014

MOOC (Massive Open Online Course): "Gut check: exploring your microbiome"




¿Te has preguntado alguna vez cuantos microorganismos viven en tu cuerpo? Las últimas estimaciones hablan de 10 por cada una de tus células. Impresionante ¿no? Ese conjunto de microorganismos, que pueden ser comensales o patógenos son lo que se conoce con el nombre de microbiota. Otro nombre con el que también se les conoce es el de flora, un remanente de cuando los microorganismos se clasificaban dentro del reino de las plantas y que algunas empresas se empeñan en mantener y en representar como un jardín bien cuidado.



Hoy lunes empieza en Coursera uno de esos MOOC (Massive Open Online Course) que merecen mucho la pena. La universidad de Colorado nos trae el curso “Gut check:exploring your microbiome”.

En este curso que dura 6 semanas nos proponen estudiar el microbioma humano y su relación con la salud y en concreto qué se puede encontrar en el tracto digestivo de un americano promedio.

Tengo que reconocer que yo ya me he apuntado y he empezado a bajarme los videos de la primera semana. Me intriga especialmente un apartado en la zona de tareas que se llama “Personal Microbiome Project”. Estaremos atentos a cómo se va desarrollando.


MOOC (Massive Online Open Course): "Gut check: exploring your microbiome"

Have you ever wondered how many microorganisms live in your body? The last estimates talk about 10 per each one of your cells. Impresive right? This set of microorganisms that can be commensal or pathogenic are known as the microbiome. Another name that is currently used is flora, a remanent of when microorganisms were classified inside the Plantae kingdom and that some companies insist on repeating and representing as a very well mantained backyard.

Today Coursera begins one of those MOOCs (Massive Open Online Course) that are really worthwhile. The university of Colorado brings us the course “Gut check: exploring your microbiome”.

This course that lasts 6 weeks offers us the opportunity to study the human microbiome, its relation with health and specifically what can be found in the gut of an average american.

I have to confess that I have already signed up and started downloading the videos of the first week. I am specially intrigued by a section in the homework area that is called “Personal Microbiome Project”. We will periodically check how it develops.

jueves, 2 de octubre de 2014

Conociendo la SEM: Grupo Docencia Y Difusión de la Microbiología




Como os contábamos en un post anterior, la Sociedad Española de Microbiología (SEM) está dividida en once grupos de trabajo especializados. 



De los once grupos, en este post os vamos a hablar del grupo de Docencia y Difusión de la Microbiología. Nos ha parecido interesante comenzar con éste ya que nuestro blog tiene un objetivo similar aunque sea de una forma más “modesta”. 

El Grupo de Docencia y Difusión de la Microbiología (D+D SEM) fue creado en 2010 por la Junta Directiva de la SEM. Como explican en su página web, este grupo surge a partir de esta idea: “La necesidad de dirigir la atención de nuestra sociedad a la problemática de la docencia de la Microbiología, así como a la difusión de nuestra ciencia”. 

La última reunión bianual de este grupo de trabajo se celebró el pasado 4 y 5 de Septiembre en la Universidad de Alicante y nosotros tuvimos la ocasión de asistir y participar con una comunicación tipo póster. 

Durante el congreso se trataron diversos temas entre los que podríamos destacar la relación entre la enseñanza preuniversitaria de la microbiología y el papel que tiene la Universidad en la actualización de sus contenidos así como la responsabilidad que tienen los profesionales de este área para hacer llegar la información a la sociedad. Ser capaces de divulgar de una forma eficaz. 



Desde aquí queremos hacer mención especial a la presentación del grupo de Jóvenes Investigadores de la SEM (JISEM). Este grupo, de reciente creación, tiene como "población diana" a los estudiantes de los últimos años de la carrera así como a investigadores en sus primeras etapas investigadoras. 
El objetivo de este grupo es establecer conexiones entre personas que estén, digámoslo así, en su primera etapa científica. Si queréis conocer más sobre ellos, sobre lo que pueden ofreceos y sobre lo que vosotros podéis aportar, podéis consultar su página web y contribuir desde ya a que coja fuerza y pueda resultar útil para todos. Desde Microbios&co os iremos contando novedades y todo lo que pueda ser interesante de esta nueva iniciativa. 


lunes, 29 de septiembre de 2014

Modelado de proteínas en 3 dimensiones (I)


Este es el primer post, de una serie en los que explicaremos como llevar a cabo el modelado de la estructura terciaria de una proteína. Esto es especialmente útil para ver cómo se organizan los aminoácidos de nuestra proteína, así como dónde se ubican los distintos dominios, zonas de unión a otras proteínas, residuos capaces de fosforilarse y fosforilar, etc.


jueves, 25 de septiembre de 2014

Bacterias como pesticidas para salvar a mi geranio

Lo reconozco, aunque que me gustan las plantas, no soy el jardinero más constante. Prueba de ello es que hasta hoy no me había dado cuenta de las manchas negras que tenía mi geranio en el tallo. Al tocarlo se notaba que estaba hueco, así que rápidamente he acudido a internet, donde en seguida he dado con la causa: el taladro del geranio, una enfermedad causada por una mariposa africana. Preocupado, he seguido leyendo para ver qué podía hacer, y me han enlazado a este post. Y ahí, entre riegos, podas e insecticidas aparecía mencionado nuestro protagonista de hoy.

Bt-toxin-crystals.jpg

"Bt-toxin-crystals" by Jim Buckman is credited and the original uploader is P.R.Johnston. - w:en:Image:Bacillus thuringiensis.JPG. Licensed under Public domain via Wikimedia Commons.

Su nombre es Bacillus thuringiensis, y resulta que es una vieja conocida: Fue descubierta a principios del s.XX por el Japonés Shigetane Ishiwatari, que vio que era el causante de la muerte rápida de los gusanos de seda. Diez años más tarde Ernst Berliner la redescubrió en la larva del gusano de la harina y le dio el nombre con el que hoy se le conoce. La bacteria es capaz de producir esporas y en el proceso se forman los cristales de proteína, llamados proteínas Cry, que son tóxicas para las larvas de varias órdenes de insectos.

Ya desde los años 20 se empezaron a usar tanto las esporas de B. thuringiensis como la proteína diluida para el control de plagas en la agricultura. Con el avance de la investigación se consiguió encontrar el gen responsable de codificar para la proteína Cry e insertarlo en diferentes plantas. ¿Os suenan los alimentos transgénicos? Efectivamente, el famoso maíz transgénico, llamado maíz BT, ha sido alterado genéticamente, añadiéndole el gen cry de B. thuringiensis, de tal manera que incorpora directamente el pesticida. También se ha insertado en otras plantas como la patata, el tabaco o el algodón.

A pesar de todos estos avances, el uso de esporas de B. thuringiensis sigue siendo una estrategia útil para el tratamiento de enfermedades. Si quieres más información sobre todo el tema, la Universidad de California, San Diego tiene una web en la que explica más en detalle cómo funciona B. thuringiensis, así como los productos modificados genéticamente.


Respecto a mi geranio, esperemos que la tala masiva y el insecticida polivalente hayan sido suficiente. Si no, tendré que buscar donde encontrar estas esporas.